LEICA APPLICATION SUITE ARCHIVE User Manual

Leica
Application
Suite
Archive
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Archivage LAS pour
la microscopie numérique
Aperçu de l'implémentation
LAS Archive permet d'associer des images à des textes, des données numériques, des informations d'un microscope et des paramètres d'un appareil photo dans les divers enregistrements de la base de données. Il est facile de définir le contenu d'un enregistrement à l'aide de l'outil Archive Design dans la barre de travail de Configuration. Axé sur la simplicité, l'outil Archive Design vous permet de définir des "niveaux" hiérarchiques de regrou­pement des données (par ex. Nom de labora­toire, Procédure, Nom du client, Expérience, N° d'échantillon, Résultat, etc.). Il n'y a pour ainsi dire aucune limite au nombre de champs différents que vous pouvez désigner ou au volume d'infor­mations que vous pouvez stocker. Les imagettes sont enregistrées dans la base de données pour un accès rapide tandis que les images haute réso­lution d'origine sont stockées à l'extérieur de la base de données. Il est également possible d'ajou­ter de nouveaux champs à une base de données existante ou de supprimer des champs redondants sans aucun problème. Les informations relati­ves au système, y compris le nom de l'opérateur, l'heure et la date, sont incluses automatiquement tandis que les paramètres du microscope et de l'appareil photo sont inclus par défaut.
Avantages
LAS Archive est entièrement intégré à
• votre microscope et votre caméra pour garantir un stockage rapide et exact des données
Le concept unique de l'interface
• utilisateur de l'application LAS offre une performance et une commodité optimales et une familiarisation rapide
L'affichage des images et des données
• peut être réglé de manière à répondre à vos besoins spécifiques
L'outil intégré de conception de base
• de données facilite la création et la personnalisation des bases de données
Le système de niveaux hiérarchiques
• permet une organisation pratique des données d'enregistrements en fonction de leurs catégories
Possibilité de joindre des enregistrements
• audio et divers autres fichiers, tels que des feuilles de calcul ou des documents Microsoft Word, pour constituer un dossier complet d'informations sur un projet
Possibilité d'acquérir des séquences
• d'images multidimensionnelles et de les manipuler aussi facilement que s'il s'agissait d'images uniques
Génération rapports à l'aide de modèles
• prédéfinis dans Microsoft Word ou création libre de vos propres modèles
Acquisition d'images
La capture de nouvelles images et l'ajout de nouveaux enregistrements est d'une simplicité extrême grâce au processus de travail structuré de l'application LAS. Vous pouvez visualiser une image en direct et la capturer directement dans la base de données et dans un "emplacement de capture" prédéfini. Vous pouvez aussi sélectionner un emplacement dans le navigateur permettant de parcourir les vues (Browse) et de capturer directe­ment l'image dans la zone désignée. Tous les para­mètres de l'appareil photo et du microscope sont automatiquement saisis dans la base de données.
Vues de données
L'application affiche les informations de différen­tes manières dans les "vues de données" de l'es­pace de travail. Vous pouvez activer ou désactiver à votre guise l'affichage des données par un seul clic sur une touche. Chaque utilisateur peut ajus­ter la zone d'affichage de chaque vue à l'écran et mémoriser sa position entre deux sessions d'utilisation.
Vue Formulaire
Cette vue affiche les données associées à l'image sélectionnée. Ces données peuvent être du texte, des mémos, des données numériques, l'heure et la date, des informations booléennes, des données relatives au microscope et à l'appareil photo, etc. Des commandes permettent de sélectionner les champs de données pertinents à afficher.
vez utiliser cette vue comme autre moyen de faire défiler l'archive et de sélectionner les enregistre­ments. Vous pouvez modifier à votre guise l'ordre des colonnes et trier les données par colonne de manière logique et intuitive.
Vue Navigation
La base de données comprend une hiérarchie de niveaux permettant d'organiser judicieusement les données dans les catégories correspondantes. Vous pouvez à votre guise créer ces catégories et les nommer pendant l'acquisition d'images. La vue Navigateur affiche les catégories sous forme d'ar­borescence, ce qui permet de sélectionner et d'af­ficher instantanément tous les enregistrements.
Vue Recherche
Une fonction de recherche rapide permet de saisir simplement le texte ou les données numériques à rechercher dans la base de données entière des champs désignés. Le navigateur de recherche affi­che ensuite l'emplacement des champs d'intérêt.
Vue Image
Cette vue affiche une seule image dans l'enre­gistrement sélectionné. Vous pouvez agrandir ou réduire l'image, la faire défiler et l'afficher en for­mat plein écran, le cas échéant.
Vue Galerie
Cette galerie d'images sophistiquée présente les images sous forme d'imagettes, chacune étant associée à un enregistrement unique. En faisant défiler la galerie, vous pouvez sélectionner rapide­ment et facilement un seul ou plusieurs enregis­trements. Vous pouvez régler la taille des imaget­tes en fonction de l'espace d'affichage disponible et de la quantité de détails recherchée.
Vue Tableau
Cette vue affiche une grille d'enregistrements sous forme de texte dont les colonnes de données correspondent aux champs sélectionnés dans la vue Formulaire. Le format est similaire à celui de la liste d'une base de données classique contenant du texte et des données numériques. Vous pou-
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Editions de LAS Archive
LAS Archive est disponible dans plusieurs édi­tions qui peuvent être associées pour répondre exactement à vos besoins. Ces éditions offrent les fonctionnalités suivantes :
LAS Archive Core
Acquisition, analyse et archivage d'images
• pour une utilisation monoposte
Structure prédéfinie de base de données
• avec un seul niveau
Définition et désignation d'une catégorie de
• recueil des images et des séquences pour faciliter la localisation
Possibilité d'utiliser sous licence des modules
• supplémentaires en option
Les autres fonctions de base comprennent la
• configuration et la commande du microscope, la commande de l'appareil photo, une échelle graphique sur l'image en direct, un calibrage calculé, une galerie d'images, des fonctions de zoom et d'affichage panoramique de l'image sélectionnée, une annotation de base et le traitement de l'image
LAS Archive Standard
Toutes les fonctionnalités de LAS Archive
• Core et de LAS Archive Basic
Une structure flexible et une interface
• utilisateur pour un monoposte
Personnalisation en fonction de vos besoins
• Inclut un outil de conception d'archives
• pour créer une base de données à niveaux multiples
Ajout de champs de données multiples à la
• base de données
Sélection du format de présentation des
• données dans la vue Formulaire
Création de rapports intégrant des images
• dans Microsoft Word
Exportation des rapports sous forme de
• fichiers pdf ou html
LAS Archive Basic
Toutes les fonctionnalités de LAS Archive
• Core
Les données du microscope et de l'appareil
• photo sont stockées avec l'image
Options de recherche de texte dans des
• champs spécifiques
Sélection des champs à afficher sur la Vue
• Formulaire
Fonction de pièces jointes
• Fonction d'enregistrement de fichiers audio
• Ajout de champs de texte à la structure de la
• base de données
LAS Archive – Fonctions principales
Conception de base de données
• Acquisition d'images et de données
• Vues de données
• Navigation, recherche et tri
• Création de rapports
• Administration de la base de données
Conception de base de données
Création de nouveaux modèles de base de
• données ou utilisation des modèles existants
Organisation des données par niveaux
• Définition du contenu de la base de données
• Champs de textes, de chiffres, date/heure,
• mots-clés
Lien vers des fichiers de données externes
Acquisition d'images et de données
Ajout d'images et de séquences d'images
• Passage à la saisie de données
• immédiatement après l'acquisition d'images
Saisie au clavier des données par l'utilisateur
• Intégration automatique des données relatives
• au microscope et à l'appareil photo
Réalisation d'un enregistrement audio d'une
• fiche de base de données
Ajout d'annotations de base et d'une échelle
• graphique
Ajout de mesures interactives
• Affichage des vues de données dans des
• formats personnalisés
Vues de données
La vue Image affiche l'image d'un
• enregistrement sélectionné
La vue Formulaire permet de saisir les
• données associées à l'enregistrement sélectionné
La vue Galerie permet de voir rapidement
• l'ensemble des images
La vue Tableau permet de comparer
• facilement les détails
La vue Navigation affiche la structure des
• données
La vue Recherche affiche les résultats de
• la recherche
Navigation, recherche et tri
Affichage individuel des enregistrements
• Défilement des enregistrements
• Sélection d'un enregistrement dans la vue
• Tableau ou Galerie
Tri des données par champ dans la vue
• Tableau
Recherche rapide d'un texte quelconque
Création de rapports
Sortie des enregistrements sélectionnés en
• fichier Microsoft Word
Les formats de sortie sont les formats pdf et
• html définis par un modèle Microsoft Word
Les images et les données sélectionnées sont
• transférées
Les rapports Microsoft Word provenant de
• LAS Archive sont facilement modifiables
Administration de la base de données
LAS Archive fonctionne sur un ordinateur
• local
L'utilisateur Windows se connecte
• Les derniers réglages définis sont enregistrés
• pour chaque utilisateur
Possibilité d'importer les données de versions
• antérieures de l'application LAS
Une copie de sauvegarde de l'archive peut
• être enregistrée sur un support de stockage et facilement restaurée
L'installation et la configuration sont
• réservées aux utilisateurs détenant des droits d'administrateur
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Imagerie numérique
performante
Dispositifs d'imagerie et de saisie de données
L'application LAS intègre l'efficacité et l'écono­mie appliquées à la photographie et la microsco­pie scientifiques ainsi qu'à l'enregistrement et au traitement d'images à l'échelle industrielle. LAS permet d'analyser, de modifier, d'évaluer et d'in­tégrer les rapports rapidement et facilement.
Appareils photo DFC Digital Firewire de Leica
Les réglages du microscope sont toujours lus
Les paramètre actuels du microscope Leica rac­cordé (série DM ou stéréomicroscope) sont tou­jours capturés avec l'image. Les paramètres sont automatiquement enregistrés dans les champs du système pendant l'enregistrement des ima­ges. Les champs sont attribués à l'image pendant la génération de la base de données et peuvent renvoyer à toutes sortes de valeurs (agrandisse­ment, filtre de fluorescence appliqué, stade X/Y et position focale, etc.). Le calibrage est réalisé automatiquement pendant la capture des ima­ges, ce qui simplifie le fonctionnement global et garantit un stockage précis des informations. Les valeurs enregistrées vous permettent d'enregis­trer des images à partir de sources partageant exactement les mêmes propriétés reproducti­bles. Pendant la génération des rapports, il est possible d'imprimer facilement et sans erreur les conditions d'enregistrement.
Option "Mémorisations"
Pour exploiter pleinement les paramètres de microscope enregistrés, cette option permet de rétablir ces paramètres à la demande de l'utili­sateur. Vous avez donc la garantie que les régla­ges du microscope pourront être facilement reproduits avec exactitude.
Modules d'acquisition de séquences
Des noeuds spécifiques avec des icônes les identifiant sont créées pour :
Les séquences en accéléré provenant de
• LAS Multitime – Time Lapse
Les films enregistrés à partir de LAS
• Multitime – Movie
Les composants et les images composites
• provenant de LAS Superposition des Images
Le balayage par stade et les d'images
• "Marquer et Trouver" provenant de LAS Multistep
Les piles Z et les images Depthmap et
• Montage provenant de LAS Montage et de LAS Multifocus
Les images mosaïque pour LAS Power
• Mosaic
Calibrage et mesures
Calibrage, mesure et annotation (Core)
La fonction de calibrage d'images autorise un calibrage manuel ou automatique et simplifie l'évaluation des objets en affichant une barre de référence du cache sur l'image en direct. Un calibrage pour chaque image peut être stocké dans l'archive.
Annotation de base (Core)
Vous pouvez annoter les images acquises par LAS en ajoutant la date, l'heure, le nom, l'échelle graphique et la ligne de distance. Cette annota­tion peut en option être incrustée dans l'image.
Module d'annotation étendue (en option)
Cette option d'annotation étendue vous permet d'intégrer des annotations telles que l'échelle graphique, un texte, des images ou des flèches sur votre image. Elles peuvent être superposées ou incrustées dans l'image pour que l'image ne soit composée que d'une couche. Les données produites par ce module peuvent être gérées directement par l'archive et rétablies au moment de l'affichage de l'image. Il est alors possible de les modifier.
Module de mesure interactive (en option)
Les modules LAS Annotation et Mesure Inter­active sont également intégrés à l'archive et le module de Mesure effectue en mode interactif la mesure, le légendage et le marquage des ima­ges. Les données de l'image ne sont pas alté­rées et les mesures et les textes sont entrées sur une couche séparée en haut de l'image. Un calibrage manuel ou calculé simplifie l'indexa­tion précise. Les connexions prévues pour les microscopes Leica autorisent une lecture auto­matique de la taille actuelle de l'échantillon. Pour de plus amples renseignements sur les divers modules disponibles en option, consultez le site www.steromicroscopy.com/LAS
LAS Archive Reporting (édition standard uniquement)
Le fonction intégrée de rapport Word rend possi­ble la génération automatisée de rapports, sous Microsoft Word 2000/XP, pour les images et tex­tes des archives LAS. Les images et leurs textes associés contenus dans les enregistrements sélectionnés peuvent être insérés dans le docu­ment texte, soit directement, soit par le biais de modèles prédéfinis. Le système d'imagettes autorise une insertion efficace des images et comme le rapport est généré dans un document normal Microsoft Word, vous disposez de toutes les fonctions familières d'édition du document avant son impression.
Vous pouvez également convertir directement le rapport en fichier pdf pour qu'il soit immédia­tement disponible. Vous pouvez aussi créer un fichier html avec une mise en page et un format d'image compatibles avec le Web. Dans ces deux derniers cas, le format a été prédéfini dans un modèle Microsoft Word. Vous n'avez pas besoin que Microsoft Word soit installé sur votre ordinateur pour créer des rapports si vous utili­sez les modèles prédéfinis fournis. Cependant, si vous souhaitez créer un format de rapport per­sonnalisé, il faudra évidemment que l'application Microsoft Word soit installée dans l'ordinateur.
Aide
A chaque fonction d'archive et boîte de dialo­gue correspond une rubrique d'aide en ligne qui décrit brièvement l'opération à exécuter, étape par étape. Pour accéder à l'aide contextuelle, il suffit d'appuyer sur la touche F1 habituelle.
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Les il lustra tions, d escript ions et don nées techn iques son t sans engage ment de not re part e t peuvent ê tre modi fiées san s préavis ,
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M1-526-1FR • © Leic a Microsy stems (Sc hweiz) AG • C H-94 35 Hee rbrugg, 2 007 • Im primé en Su isse – VII I,20 07 – RDV
www,leica-microsystems,com/LAS
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