Agilent 6300 User Manual
Systèmes CPL/SM à trappe d’ions Agilent série 6300
CPL/SMnsouple hautes performances
Des niveaux de performances
correspondant à vos applications
et à votre budget
Que vous recherchiez des protéines de faible
abondance, des métabolites de médicaments
dans des matrices complexes ou des résidus
de pesticides dans des produits alimentaires,
il existe un système CPL/SM à trappe d’ions
série 6300 adapté à vos attentes. En outre,
quelle que soit la trappe d’ions série 6300
que vous choisissiez, elle comprendra une
acquisition des données à grande vitesse et
à faible coût pour une compatibilité avec la
chromatographie moderne haute résolution.
La série 6310 rend la SM nhautes
performances économique
La série 6310 est une valeur sûre, dotée de
caractéristiques exceptionnelles de sensibilité, de souplesse et de fiabilité. Elle
associe un changement de polarité rapide
à des capacités d’acquisition dépendantes
des données pour augmenter la quantité de
données que vous pouvez acquérir en une
seule analyse.
La série 6320 offre une sensibilité,
une résolution de masse et une
vitesse de balayage supérieures
La trappe d’ions grande capacité de la série
6320 augmente la sensibilité et les performances à tous les niveaux. La série 6320 a
une vitesse de balayage de 26 000 u/s avec
une résolution supérieure à l’unité, et propose
un mode “ spécial peptides “ pour améliorer
l’identification des protéines de faible
abondance.
Souplesse sans précédent de la CPL/SMnhautes performances
Avec quatre niveaux de performances, une large gamme de choix d’ionisation, un logiciel spécifique de
l’application et une vaste sélection de technologies de CPL, les systèmes CPL/SM à trappe d’ions Agilent
série 6300 s’adaptent à la plupart des types d’analyse. Une technologie éprouvée alliée à la fiabilité
légendaire d’Agilent vous garantit à tout moment les performances dont vous avez besoin.
2
La série 6330 offre une sensibilité
exceptionnelle aux analytes de
faible abondance
Grâce à un nouveau détecteur haute
résolution, la trappe 6330 est probablement
la trappe d’ions la plus sensible disponible
pour les applications réelles. Elle atteint une
sensibilité maximale sans altérer la vitesse
de balayage ni la résolution comme les
trappes d’ions en deux dimensions.
La série 6340 améliore la
caractérisation PTM et
l’identification des protéines
La série 6340 offre les performances exceptionnelles de la série 6330 et permet en outre
des dissociations induites par transfert
d’électrons (ETD). Les ETD constituent une
autre technique de fragmentation fournissant
une image plus complète des séquences
peptidiques et des emplacements des
difications chimiques.
3
www.agilent.com/chem/iontrap
321,9
323,0
0,00
0,25
0,50
0,75
1,00
1,25
x10
6
Intens.
320
321 322 323 324 325 326 327 328 329
m/z
Spectre de SM Pic
à 322 m/z
2121,8
2122,8
2123,8
0
1
2
3
4
2121
2122 2123 2124 2125
m/z
Spectre de SM Pic
à 2 122 m/z
FWHM
R = M/delta M @ 50 %
R = 2 121,8/0,34
Résolution = 6 241
R = M/delta M @ 50 %
R = 322,1/0,27
Résolution = 1 185
x10
6
Intens.
BPC 400-1 200 m/z
1 fmole BSA dans la colonne
0,0
0,5
1,0
1,5
Intens.
0,0
0,5
1,0
1,5
x10
6
1
2 3 4 5
Durée [min]
391,5
518,3
569,9
722,7
Spectre de SM 3,1-3,2 min
249,1
321,1
437,2
535,3
584,3
650,4
704,9
778,4
892,4
1007,5
1167,5
Spectre de SM/SM 722,7 m/z
0
1
2
3
x10
5
Intens.
0
1
2
3
x10
4
200
400
600 800 1000 1200
1400
m/z
x10
6
Fragmento-grammes extraits 722,7 m/z
1 fmole BSA dans la colonne
Une analyse d’une femtomole de digestion de BSA dans une colonne par la trappe 6330 montre
une sensibilité exceptionnelle
Systèmes CPL/SM à trappe d’ions Agilent série 6300
Avec les trappes d’ions tridimensionnelles, vous n’avez pas besoin de sacrifier la vitesse de balayage pour la résolution. Cette analyse de perfluorophosphozines
sur une large gamme de masse 200 - 2 200 m/z, réalisée avec une trappe 6320, démontre une excellente résolution à une vitesse de balayage de 8 100 u/s.
linéaire supérieure. Cette résonance non
linéaire transfère très efficacement de l’énergie
aux ions pour une éjection rapide et précise
depuis la trappe. Vous obtenez ainsi une
association supérieure de gamme de masse, de
résolution de masse et de vitesse de balayage.
Le verrouillage de phase breveté contrôle avec
précision le débit d’éjection des ions, entraînant
une reproductibilité élevée entre balayages et
augmentant la fiabilité de vos résultats.
Une manière plus efficace
d’augmenter la capacité et la
sensibilité de la trappe
La capacité de la trappe a un impact direct
sur la sensibilité. Certains fabricants ont
choisi une géométrie de trappe d’ions en
deux dimensions comme moyen simple
d’augmenter la capacité de la trappe. Toutefois, les trappes d’ions en deux dimensions
compromettent d’autres paramètres de
fonctionnement importants, tels que la
vitesse de balayage et la résolution de
masse. Elles nécessitent également deux
détecteurs pour une sensibilité optimale.
Les détecteurs doubles peuvent diminuer
la fiabilité et augmenter les exigences de
maintenance.
Agilent a augmenté la capacité des trappes
d’ions tridimensionnelles de la série 6300
grâce à un réglage minutieux de la géométrie
du dispositif, aux matériaux, à la fabrication
de précision et aux paramètres de fonctionnement définis. La capacité obtenue est
élevée et offre les avantages de vitesse de
balayage et de résolution inhérents aux
trappes d’ions tridimensionnelles.
Une technologie de trappe d’ions
avancée pour des performances
optimales
Dans les trappes d’ions, la précision de masse,
la résolution de masse et la vitesse de balayage
dépendent considérablement de la vitesse et
du débit d’éjection des ions. La trappe d’ions
multipolaire tridimensionnelle brevetée utilisée
dans la série 6300 crée une résonance non
4
Les dissociations induites par
transfert d’électrons améliorent la
couverture des séquences peptidiques et l’emplacement des PTM
La CPL/SM à trappe d’ions Agilent 6340
propose non seulement la fragmentation
CID standard, mais aussi une autre forme
de fragmentation appelée “ dissociations
induites par transfert d’électrons “ (ETD),
capable d’améliorer les analyses protéomiques. Les ETD produisent essentiellement
des ions de séries c et z. Les ETD fournissent
généralement une fragmentation plus régulière sur un peptide que la CID, d’où une
couverture de séquences supérieure. Cette
plus grande couverture de séquences
améliore l’identification des protéines par
une recherche dans une base de données
ou un séquençage de novo.
261,1
331,2
430,3
517,2
673,2
766,3
830,8
1168,0
1243,6
1532,6
1654,6
1904
2002,9
0
200
400
600
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 2000 m/z
z
4
414,1
543,2
680,4
802,3
1033,7
1090,5
1237
1351
1402,7
1661
c
4
[M+3H]
3+
[M+2H]
2+
932,5
IADP
H
DH
T
GF
L
t
E
y
V
ATR
1790
1922
A
RT V
y
Et L F GTHDHE
PDAI
347,4 446,5
684,0
822,3
894,8
943,8
0,0
0,2
0,4
0,6
0,8
1,0
x10
4
~ x 4
559,5
ETD
z
5
z
3
z
2
z
9
z
11
z
13
z
6
z
14
z
15
c
5
c
9
++
c
9
c
6
c
10
c
8
c
11
c
13
++
c
14
++
c
12
c
16
c
14
c
13
c
15
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 2000 m/z
y
4
y
3
y
9++
y
17-H3PO4
3+
[M+2H - H3PO4]
3+
b
15
-H
3
PO
4
3+
b
15
-H
3PO4
++
b
15
++
b
12
++
b
14
++
Phosphopeptide IADPEHDHTGFLtEyVATR
CID
Spectres CID et ETD SM/SM du phosphopeptide IADPEHDHTGFLtEyVATR de la protéine ERK humaine recombinante (ERK 1). Le spectre CID montre une certaine
fragmentation, mais l’ion dominant provient de la perte d’acide phosphorique. Le spectre ETD montre des séries c et z presque complètes. Dans le spectre ETD,
les emplacements des phosphorylations peuvent être identifiés directement à partir du spectre.
En outre, avec les ETD, les modifications
post-traductionnelles, telles que la
phosphorylation ou la glycosylation, restent
généralement fixées à l’acide aminé durant
la fragmentation. Ceci permet de déterminer
plus facilement l’emplacement spécifique
de la modification.
La série 6340 peut acquérir des spectres CID
ou ETD, selon les besoins de votre application.
La série 6340 peut également passer d’une
fragmentation CID à une fragmentation
ETD d’un balayage à un autre, pour l’image
la plus complète possible de l’identité des
protéines et des emplacements précis des
modifications chimiques. Un mode spécial
d’acquisition dépendant des données est
disponible pour déclencher une nouvelle
accumulation et des ETD en cas de pertes
de neutres spécifiées par l’utilisateur.
Davantage de solutions de
fragmentation
La dissociation par excitation rapide est
un nouveau mode de fonctionnement CID.
Il élimine la “ coupure 1/3 “ associée
aux spectres CID traditionnels de trappe
d’ions. Ceci permet de piéger les ions de
produit de masse faible nécessaires pour
les applications telles que l’étiquetage
d’isotopes iTRAQ. Agilent prévoit d’introduire la dissociation par excitation rapide
dans la série 6300 en 2007.
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