ROTI®Garose for analytical gels Agarose HR-PLUS, 100 g User guide

Gebrauchsanweisung

ROTI®Garosen

Agarosen für jede Gelegenheit

• Für klare und scharfe Banden

• Gele mit hoher Transparenz

• Niedriger Hintergrund

• Geeignet für alle Standard-Laufpuffer und

high-speed Puffersysteme

• Geeignet für alle Nukleinsäure-Färbesysteme

• Nicht-toxisch in Zellimmobilisationsassays

• Natürlich DNAse- und RNAse-frei

I. Einleitung:

ROTI®Garose ist ein neutrales Polysaccharid, das in vielen
Aufreinigungsschritten aus der Zellwand bestimmter Algen,
Rhodophyceen, gewonnen wird. ROTI®Garose bildet mit
allen gängigen Laufpuffern sehr klare Gele und bewirkt eine
scharfe und eindeutige Auftrennung Ihrer Biomoleküle. Die
sehr reine Agarose zeigt sehr wenig störende Bindung an
Färbereagenzien und ergibt nach dem Färben eine
hintergrundarme, kontrastreiche Darstellung.

ROTIi®
Garose

Best.
Nr.

Anwendung

Standard

3810

Routinegele, Praktika, einfache Analysen (1-20 kb)

NEEO Ultra­Qualität

2267

Alle Standard-Anwendungen, qualitative und
quantitative Gele, Screening und Blotting.

Agarose­Tabletten
(0,5g/Tab.)

HP67

Für hochreproduzierbare Gele oder einfache
Anwendungen in Praktikum oder Schule. Alle
Standard-Gele (0,5-2,5 %)

GTQ

6352

Gentechnik-Qualität, zur DNA-Elution von Fragmenten
≥500 bp ohne Schmelzen der Agarose.

Broad
Range

T846

Für den gesamten analytischen Hauptbereich
(200 bp bis 40 kb), Blotting, Shift Assays. Optimal,
wenn im Labor nur wenige Agarosetypen verwendet
werden sollen.

ROTI®
Garose

Best.
Nr.

Anwendung

Pulsed-Field

3771

Trennung großer Fragmente (ab 20 kb),
Pulsed-Field-Gelelektrophorese (PFGE).

HR PLUS

HP30

Analyse von Fragmenten zwischen 100 und 3000 bp.

High
Resolution

K297

Analyse von Fragmenten zwischen 50 und 1000 bp.

Low Melt

6351

Mit niedriger Schmelz- und Geliertemperatur
(ST ≤65,5°C, GT ≤28°C). Für Gelelutionen aus
geschmolzener Agarose.

LM / PCR

HP31

Gentechnik-Qualität mit niedriger Schmelz- und
Geliertemperatur (ST ≤65°C, GT ≤35°C). Zur DNA­Elution von Fragmenten <1500 bp aus geschmolzener
Agarose.

Super LM

HP45

Mit besonders niedriger Schmelz- und
Geliertemperatur (ST ≤62°C, GT ≤20°C). Für
Gelelutionen aus geschmolzener Agarose. Empfohlen
für in-Gel-Analysen, Kapillarelektrophorese und Zell­und Gewebskultur.

MEEO Ultra­Qualität

2268

Mit mittlerer EEO. Für Immun-, Serum und Antikörper­Elektrophorese.

HEEO Ultra­Qualität

2269

Mit hoher EEO. Für Proteinauftrennung und
Gegenstrom-Elektrophorese.

Synergel®

0184

Agarose-Additiv zur feineren Porenbildung. Erhöht die
Trennleistung der Agarose. Für Fragmente ab 10 bp.

II. Zusammensetzung:
Chemisch handelt es sich um ein Galactan, das bereits bei
niedrigen Konzentrationen in der Lage ist, recht feste Gele zu

bilden. Die Porengröße dieser Gele wird durch die
Konzentration der verwendeten Agarose vorgegeben. Durch
das Fehlen ionischer Gruppen im Gel werden auch
hydrophile Stoffe ohne Interaktion mit der Gelmatrix nach
Größe aufgetrennt. Die hohe Hysterese der Agarosen, also
die thermische Stabilität nach dem Erstarren, gewährleistet,
dass die Gele auch unter wärmeerzeugenden
Laufbedingungen zuverlässig stabil bleiben.

III. Anwendung:

Verwenden Sie Schutzkleidung, Hitzeschutzhandschuhe und
Augenschutzbrillen.

1.) Wiegen Sie die Agarose ab und geben Sie sie unter
Rühren zu der gewünschten Menge Elektrophoreselaufpuffer

in ein Gefäß, das mindestens 2 Volumina der angesetzten
Menge fasst.

2.) Agarose-Tabletten: 1 Tablette = 0,5 g.
Geben Sie die gewünschte Anzahl Tabletten in die
erforderliche Menge Elektrophoreselaufpuffer.

Tabletten

Puffer

Gelkonzentr.

1

100 ml

0,5 %

1

62,5 ml

0,8 %

1

50 ml

1 %

2

75 ml

1,5 %

2

50 ml

2 %

Lassen Sie die Agarose-Tabletten 5 Min. bei
Raumtemperatur zerfallen.

Optional für alle Agarosen: Lassen Sie die Agarose 15 Min.
bei Raumtemperatur einweichen. Dieser Schritt reduziert die
Gasbildung beim Schmelzen.

3.) Wiegen Sie das Gefäß.

4.) Erhitzen Sie die Agaroselösung in der Mikrowelle oder im
Wasserbad bis gerade zum Kochen.

5.) Schwenken Sie die Lösung vorsichtig zum Mischen.
Beachten Sie bitte: Die Agarose kocht leicht über, wenn Sie

die heiße Glaswand berührt.

6.) Wiederholen Sie die Schritte 4.) und 5.), bis die gesamte
Agarose gelöst ist und nicht mehr entgast.

Beachten Sie bitte: Hochprozentige Agarose entgast stärker
und muss vorsichtiger gekocht werden. Beim Ansatz
hochprozentiger Agarose ab 2 % sollte man bereits zwischen
den Lösungsschritten etwas fehlendes Wasser ersetzen (s.

7.), um die Konzentration nicht übermäßig zu erhöhen.

7.) Wiegen Sie das Gefäß und ersetzen Sie die fehlende
Menge durch heißes destilliertes Wasser.

8.) Kühlen Sie die Agarose im Wasserbad oder unter
fließendem Wasser unter Schwenken auf ca. 50 – 60 °C ab,
und gießen Sie das Gel.

9.) Lassen Sie das Gel abkühlen.
Optional: Bei Agarose geringer Gelstärke wie der High

Resolution oder den Low-Melting Agarosen empfehlen wir,
das Gel vor dem Lauf für 30 Min. bei ca. 4 °C zu kühlen.

IV. Lagerung:

Wir empfehlen, die Agarosen bei Raumtemperatur (20 - 24
°C) zu lagern. Eine Langzeitlagerung kann auch gekühlt
erfolgen (4 – 8 °C).

V. Qualitätssicherung:

Jede Charge ROTI®Garose wird auf DNase/RNase-Freiheit
und Funktionalität in der Elektrophorese getestet.

VI. Laufweiten von Xylencyanol (XC) und
Bromphenolblau (BPB) in bp in Abhängigkeit von
Agarose, Gelstärke und Puffersystem:

3810

Standard

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

16000

6200

2800

1300

BPB

1600

500

300

150

1xTBE

XC

12000

4200

1800

900

BPB

1300

400

200

70

2267

NEEO

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

16000

6100

2800

1300

BPB

1650

500

300

150

1xTBE

XC

12000

4100

1800

850

BPB

1350

400

200

70

HP67

A. Tabletten

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

15000

5000

2600

1500

BPB

1800

650

400

200

1xTBE

XC

11000

4000

1800

800

BPB

1100

350

150

60

6352

GTQ

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

15000

5000

2600

1500

BPB

1800

650

400

200

1xTBE

XC

11000

4000

1800

800

BPB

1100

350

150

60

T846

Broad R.

0,3 %

0,7 %

1,2 %

1,7 %

1xTAE

XC

30000

11200

3900

1700

BPB

4000

1200

520

300

1xTBE

XC

18000

10000

4500

1800

BPB

2200

950

450

200

3771

Pulsed-Field

0,3 %

0,5 %

1 %

1,5 %

1xTAE

XC

24800

13000

6100

2600

BPB

3550

2050

760

400

1xTBE

XC

19400

10000

4000

1900

BPB

2550

1500

500

250

HP30

HR PLUS

1 %

2 %

3 %

4 %

1xTAE

XC

2500

1000

400

200

BPB

250

150

100

60

1xTBE

XC

1500

600

200

120

BPB

100

60

50

<50

K297

High Res.

2 %

3 %

4 %

5 %

1xTAE

XC

600

300

160

100

BPB

100

80

40

25

1xTBE

XC

400

150

80

50

BPB

<50

<50

<20

<20

6351

Low Melt

1 %

1,5 %

2 %

2,5 %

1xTAE

XC

2800

1350

720

410

BPB

425

225

120

75

1xTBE

XC

1600

800

400

200

BPB

200

80

40

20

HP31

LM / PCR

2 %

3 %

4 %

5 %

1xTAE

XC

600

300

120

60

BPB

100

80

40

20

1xTBE

XC

400

150

60

40

BPB

50

40

20

<20

HP45

Super LM

1 %

1,5 %

2 %

2,5 %

1xTAE

XC

2800

1350

720

410

BPB

425

225

120

75

1xTBE

XC

1600

800

400

200

BPB

200

80

40

20

Sortiment ROTI®Garosen

Standard 3810.1 10 g

3810.2 100 g

3810.5 250 g

3810.3 500 g

3810.4 1 kg
NEEO Ultra-Qualität 2267.1 10 g

2267.2 100 g

2267.5 250 g

2267.4 500 g

2267.3 1 kg
Agarose-Tabletten HP67.6 20 Tabl.
HP67.7 200 Tabl.
HP67.8 600 Tabl.

GTQ (Gentechnikqualität) 6352.1 10 g

6352.2 100 g

6352.4 500g

Broad Range T846.1 10 g

T846.2 100 g
T846.3 500 g
Pulsed-Field 3771.1 10 g

3771.2 25 g

3771.3 100 g

3771.4 250 g
HR-PLUS HP30.1 10 g
HP30.2 100 g
HP30.3 500 g
High Resolution K297.1 10 g
K297.2 100 g
K297.3 500 g
Low Melt 6351.1 5 g

6351.5 25 g

6351.2 100 g

6351.4 500 g
LM/PCR HP31.1 5 g
HP31.2 100 g
HP31.3 250 g
Super LM HP45.1 5 g
HP45.2 100 g
HP45.3 250 g
MEEO Ultra-Qualität 2268.1 10 g

2268.2 100 g

2268.3 1kg

2268.4 500g
HEEO Ultra-Qualität 2269.1 10 g

2269.2 100 g

2269.3 1 kg

ROTI®Garose

Agaroses for all applications

• For clear and sharp bands

• Gels with high transparency

• Low background

• Suitable for all standard running buffers

• Compatible with all nucleic acid staining

systems

• Non-toxic in cell immobilisation assays

• Of course DNase and RNase free

l. Introduction:

ROTI®Garose is a neutral polysaccharide which is obtained in
many purification steps from the cell wall of certain algae and
red algae. ROTI®Garose forms very clear gels with all
standard running buffers and will result in a sharp and clear
separation of your bio molecules. Extremely pure agarose
with very low interference binding to staining reagents which
produces a low background and high contrast appearance
after staining.

ROTIi®
Garose

Art.
No.

Application

Standard

3810

Routine gels, student’s courses, general analyses
(1-20 kb).

NEEO Ultra­Quality

2267

All standard applications, qualitative and quantitative
gels, screening and blotting.

Agarose
tablets
(0.5g/tab.)

HP67

For highly reproducible gels, or simple applications in
student courses. All standard gels (0.5-2.5 %).

GTQ

6352

Genetic engineering quality, for DNA-elution of
fragments ≥500 bp without melting the agarose.

Broad
Range

T846

For the total analytical range (200 bp up to 40 kb),
blotting, shift assays. Ideal when only a few agaroses
are to be used in the laboratory.

Pulsed-Field

3771

Separation of large fragments (over 20 kb), Pulsed­Field Gel Electrophoresis (PFGE).

HR PLUS

HP30

Analysis of fragments between 100 and 3000 bp.

High

K297

Analysis of fragments between 50 and 1000 bp.

Resolution

Low Melt

6351

With low melting and gelling temperatures
(MT ≤65.5 °C, GT ≤28 °C). For gel elution from
melted agarose.

LM / PCR

HP31

Genetic engineering quality with low melting and
gelling temperatures (MT ≤65 °C, GT ≤35 °C). For
DNA-elution of fragments <1500 bp from melted
agarose.

Super LM

HP45

With extremely low melting and gelling temperatures
(MT ≤62 °C, GT ≤20 °C). For gel elution from melted
agarose. Recommended for in-gel analysis, capillary
electrophoresis and cell and tissue culture.

MEEO Ultra­Quality

2268

With medium EEO. For immune, serum and antibody
electrophoresis.

HEEO Ultra­Quality

2269

With high EEO. For protein precipitation and counter
current electrophoresis.

Synergel®

0184

Agarose additive for finer pore formation. Increases
the separative power of the agarose. For fragments
from 10 bp up.

II. Composition:

Chemically this is a galactan which is capable of forming
extremely solid gels, even at a low concentration. The pore
size of the gels is determined by the concentration of the
agarose used. Because there are no ionic groups in the gel,
hydrophilic materials without any interaction with the gel
matrix will also be separated according to their size. The high
hysteresis of the agarose, that is the thermal stability after
solidification, ensures that the gels remain reliably stable
even during heat-producing running conditions.4

lll. Application:

Please use adequate protection and guard yourself and
others against scalding solutions. We recommend to wear
eye protection and heat preservation gloves.

1.) Weigh the required amount of agarose and add to
required amount of electrophoresis running buffer while the
solution is rapidly stirred. The beaker should be at least twice
as big as the amount of buffer used.

2.) Agarose tablets: 1 tablet = 0.5 g.
Add the required number of tablet to the required amount of
electrophoresis running buffer.

Tablets

Buffer

Gel concentration

1

100 ml

0.5 %

1

62,5 ml

0.8 %

1

50 ml

1 %

2

75 ml

1.5 %

2

50 ml

2 %

Incubate for 5 mins. at room temperature to dissolve tablets.
Optional for all agaroses: Incubate agarose for 15 mins. at

room temperature to reduce the production of gas during
heating.

3.) Weigh the beaker.

4.) Heat the agarose solution in the microwave oven or in the
water bath until it just cooks.

5.) Carefully swirl the beaker to mix the agarose solution.
Please note: Agarose tends to become overheated and foam

when touching the hot glass during swirling.

6.) Repeat steps 4.) and 5.) until the agarose has been
solved completely and has stopped degassing.

Please note: Agarose of high percentage degases strongly
and has to be cooked very carefully. When dissolving
agarose of 2 % and more, hot water should be added already
between two heating steps to avoid exceeding concentration
of the solution.

7.) Again weigh the beaker and replace the missing weight by
hot, distilled water.

8.) Let the agarose cool in a water bath or under flowing
water (under constant swirling) to approx. 50 – 60 °C. Pour
the gel.

9.) Let the gel cool.
Optional: When using agarose of low gel strength like High

Resolution or Low-Melting agaroses we recommend to cool
the gel prior to the run for 30 mins. at approx. 4 °C.

IV. Storage:

We recommend storing the agarose at room temperature (20
– 24 °C). Long-term storage may also be done at 4 – 8 °C.

V. Quality assurance:

Every ROTI®Garose batch is tested for being DNase/RNase­free and for functionality in electrophoresis.

VI. Running distance in bp of xylene cyanol (XC) and
bromophenol blue (BPB), with respect to agarose, gel
concentration and buffer system used.

Instructions for use

3810

Standard

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

16000

6200

2800

1300

BPB

1600

500

300

150

1xTBE

XC

12000

4200

1800

900

BPB

1300

400

200

70

2267

NEEO

0,5 %

1 %

1,5 %

2 %

1xTAE

XC

16000

6100

2800

1300

BPB

1650

500

300

150

1xTBE

XC

12000

4100

1800

850

BPB

1350

400

200

70

HP67

A. Tablets

0.5 %

1 %

1.5 %

2 %

1xTAE

XC

15000

5000

2600

1500

BPB

1800

650

400

200

1xTBE

XC

11000

4000

1800

800

BPB

1100

350

150

60

6352

GTQ

0.5 %

1 %

1.5 %

2 %

1xTAE

XC

15000

5000

2600

1500

BPB

1800

650

400

200

1xTBE

XC

11000

4000

1800

800

BPB

1100

350

150

60

T846

Broad R.

0.3 %

0.7 %

1.2 %

1.7 %

1xTAE

XC

30000

11200

3900

1700

BPB

4000

1200

520

300

1xTBE

XC

18000

10000

4500

1800

BPB

2200

950

450

200

3771

Pulsed-Field

0,3 %

0,5 %

1 %

1,5 %

1xTAE

XC

24800

13000

6100

2600

BPB

3550

2050

760

400

1xTBE

XC

19400

10000

4000

1900

BPB

2550

1500

500

250

HP30

HR PLUS

1 %

2 %

3 %

4 %

1xTAE

XC

2500

1000

400

200

BPB

250

150

100

60

1xTBE

XC

1500

600

200

120

BPB

100

60

50

<50

K297

High Res.

2 %

3 %

4 %

5 %

1xTAE

XC

600

300

160

100

BPB

100

80

40

25

1xTBE

XC

400

150

80

50

BPB

<50

<50

<20

<20

6351

Low Melt

1 %

1.5 %

2 %

2.5 %

1xTAE

XC

2800

1350

720

410

BPB

425

225

120

75

1xTBE

XC

1600

800

400

200

BPB

200

80

40

20

HP31

LM / PCR

2 %

3 %

4 %

5 %

1xTAE

XC

600

300

120

60

BPB

100

80

40

20

1xTBE

XC

400

150

60

40

BPB

50

40

20

<20

HP45

Super LM

1 %

1.5 %

2 %

2.5 %

1xTAE

XC

2800

1350

720

410

BPB

425

225

120

75

1xTBE

XC

1600

800

400

200

BPB

200

80

40

20

Assortment ROTI®Garoses

Standard 3810.1 10 g

3810.2 100 g

3810.5 250 g

3810.3 500 g

3810.4 1 kg
NEEO Ultra-Quality 2267.1 10 g

2267.2 100 g

2267.5 250 g

2267.4 500 g

2267.3 1 kg
Agarose Tablets HP67.6 20 tabl.
HP67.7 200 tabl.
HP67.8 600 tabl.

GTQ 6352.1 10 g
(for genetic engineering) 6352.2 100 g

6352.4 500 g
Broad Range T846.1 10 g
T846.2 100 g
T846.3 500 g
Pulsed-Field 3771.1 10 g

3771.2 25 g

3771.3 100 g

3771.4 250 g
HR-PLUS HP30.1 10 g
HP30.2 100 g
HP30.3 500 g
High Resolution K297.1 10 g
K297.2 100 g
K297.3 500 g
Low Melt 6351.1 5 g

6351.5 25 g

6351.2 100 g

6351.4 500 g
LM/PCR HP31.1 5 g
HP31.2 100 g
HP31.3 250 g
Super LM HP45.1 5 g
HP45.2 100 g
HP45.3 250 g
MEEO Ultra-Quality 2268.1 10 g

2268.2 100 g

2268.3 1 kg

2268.4 500 g
HEEO Ultra-Quality 2269.1 10 g

2269.2 100 g

2269.3 1 kg

Carl Roth GmbH + Co. KG

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