PCR D7233 User Manual

PCR Kit with Taq
产品编号 产品名称 包装
D7233 PCR Kit with Taq 2000
产品简介:
¾ PCR试剂盒带有Taq DNA PolymerasePCR bufferdNTP和上样缓冲液,自备模板和引物即可进行PCR反应,适合用于
普通的PCRRT-PCR定性或定量检测,也可以用于不太长的的DNA片断的克隆。
¾ Taq DNA Polymerase简称Taq酶或Taq,是最常用的DNA聚合酶之一。 ¾ Taq DNA Polymerase是一种来源于嗜热菌Thermus aquaticus的高度热稳定的DNA聚合酶,95℃孵育时的半衰期大于40
¾ 活性定义:One unit of the enzyme catalyzes the incorporation of 10 nmol of deoxyribonucleotides into a polynucleotide fraction
(adsorbed on DE-81) in 30 min at 70
6.7 mM MgCl dNTP, 0.4 MBq/ml [
¾ 纯度:不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶,不含RNA酶,满足常规PCR反应要求。 ¾ 酶储存溶液:20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 100 mM KCl, 0.5% (v/v) Nonidet P40, 0.5% (v/v) Tween 20
and 50% (v/v) glycerol
¾ 10×PCR Buffer (with Mg ¾ 失活或抑制:酚氯仿抽提可以使Taq酶失活,加入脱氧胆酸钠至0.06%SDS0.01%,或sarkosyl0.02%均可以抑制Taq
酶。
¾ 试剂盒带有dNTP,该dNTP为dATPdCTPdGTPdTTP的混合物,每种的浓度均为2.5mM ¾ 本试剂盒用于50微升的PCR反应体系,足够用于800个反应,用于20微升的PCR反应体系,足够用于2000个反应。
, 1 mM 2-mercaptoethanol, 50 mM NaCl, 0.1 mg/ml BSA, 0.75 mM activated calf thymus DNA, 0.2 mM of each
2
3
H]dTTP
2+
)100 mM Tris-HCl (pH 8.8 at 25), 500 mM KCl, 15mM MgCl2, 0.8% (v/v) Nonidet P40
. Enzyme activity is assayed in the following mixture: 67 mM Tris-HCl (pH 8.8 at 25℃),
包装清单:
产品编号 产品名称 包装
D7233-1 Taq DNA Polymerase (5U/µl) 1000U D7233-2 10×PCR Buffer (with Mg2+) 1ml×4 D7233-3 dNTP (2.5mM each) 0.8ml×4 D7233-4 6×DNA Loading Buffer 1ml×2
说明书 1份
保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
¾ 由于PCR反应非常灵敏可以扩增目的基因序列超过1000万倍,在使用Taq酶时请注意避免微量待扩增DNA的污染,并尽量
考虑设置不加模板的空白对照以确认是否有待扩增DNA的污染。
¾ Taq DNA polymerase在PCR过程中每循环的出错几率约为2.2x10
DNA聚合酶,例如Pfu DNA polymeraseBeyoTaq DNA polymerase等。对于普通的PCRRT-PCR定性检测或定量检 测,Taq DNA polymerase是最佳选择。
¾ 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
-5
,对于大于1kbDNA片断的克隆推荐使用出错几率更低
使用说明:
1. PCR反应体系的设置: a.
溶解并混匀PCR反应所需的各种溶液。将Taq DNA Polymerase置于冰浴上或冰盒内。
b. 参考下表在冰浴上设置PCR反应(如果有多个类似的PCR反应,可以先配制大体积的包含水、bufferdNTPTaq酶的
混合物,然后分装到各PCR反应管内。根据情况,有时混合物中可以包括引物):
试剂 最终浓度
双蒸水或MilliQ - (36.75-x)µl (14.7-y)µl
10×PCR Buffer (with Mg2+) 5µl 2µl
dNTP (2.5mM each) 0.2mM each 4µl 1.6µl
模板DNA 10pg-1µg* xµl yµl
引物混合物(10µM each) 0.8µM 4µl 1.6µl
Taq DNA Polymerase (5U/µl) 1.25U/50µl 0.25µl 0.1µl
总体积 - 50µl 20µl
*对于不同类型的模板在50µl反应体积中推荐用量如下:
哺乳动物基因组DNA:0.1-1µg;大肠杆菌基因组DNA:10-100ng;质粒DNA:0.1-10ng。 过多的模板DNA容易导致非特异性的PCR产物。
c. 用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vor tex混匀,室温离心数秒,使液体积聚于管底。 d. 如果所使用的PCR仪有热盖则省略本步骤。如果PCR仪没有热盖,则在管内滴入一滴矿物油(mineral oilST275) e. 各设置好的PCR反应管置于PCR仪上,开始PCR反应。
2. PCR反应参数的设置可以参考如下示例: STEP1(起始变性): 94 3min STEP2(变性): 94 30sec STEP3(退火): 55 30sec STEP4(延伸): 72 1min STEP5(循环): Go To STEP2 for 30 cycles STEP6(最终延伸): 72 10min STEP6(临时保存): 4 forever
a. PCR反应的设置需根据模板、引物、PCR产物的长度和GC含量等条件的不同设定不同的PCR反应条件包括温度、时
间和循环数等。
b. STEP4(延伸)的时间设置需根据PCR产物的长度进行设置,通常每kb产物的延伸时间为1分钟。例如PCR产物的长度
1kb,则延伸时间可以设置为1分钟,PCR产物的长度为2kb,则延伸时间可以设置为2分钟,以此类推。
c. 对于初次进行的PCR,为尽量确保可以扩增出预期的PCR产物,可以把循环数设置为35。对于需进行半定量或定量
PCR反应循环数一定要进行适当优化,使PCR反应没有达到平台期。
体积 体积
常见问题:
1. PCR产物非常少或没有特异性条带。 a. 引物设计不佳是PCR过程中最常见的问题。请选择适当的引物设计软件进行引物设计,注意引物的GC含量、二级结
构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。在加入酶切位点等的引物中,一定要注意加入酶切位点等后 整条引物的GC含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。在原有引物效果不佳的情况并且 阳性对照引物可以正常工作的情况下,可以考虑更换引物。
b. 待扩增片断GC含量偏高。GC含量较高的情况下PCR会变得相对比较困难,此时可以使用适合扩增高GC含量DNA
断的GC-rich buffer,并相应地根据GC-rich buffer的要求或说明调整PCR反应参数的设置。
c. 长片断扩增。尽管Taq DNA polymerase可以扩增最长达8kb的DNA片断,但大多数时候比较适合扩增3kb以下的片
断,更长片断的扩增推荐使用其它更适合长片断扩增的DNA聚合酶。
d. PCR反应设置时在室温进行容易导致非特异性条件。推荐在冰浴上设置PCR反应。 e. 由于引物存在一定的二级结构或存在一定的引物二聚体,或引物偏短,导致退火效果不佳。此时可以采用Touch
down等方法进行退火,通常采用从65℃逐步缓慢降温到55或50℃的方法,使退火更加充分。
f. 退火温度不佳,需要优化。如果有温度梯度PCR仪,则可以设置退火的温度梯度,摸索退火的最佳温度。如果没有
温度梯度PCR仪,则可以通过多次PCR反应摸索最佳的退火温度。 g. 延伸时间不足。可按照每1kb片断延伸1分钟进行设置,对于较难扩增的片断可以设置为每1kb片断延伸1.5-2分钟。 h. 待扩增片断GC含量较高或长度较长,变性不够充分。可以调节起始变性条件至95℃ 1min甚至95℃ i. 在不同PCR仪上进行PCR反应,避免有时PCR仪出现问题。 j. 循环数不足,适当延长PCR的循环数。通常循环数最高不必超过40,常用的循环数范围为25-35 k. 模板含量太低,适当加大模板量,或采用巢式PCR(nested PCR)或二次PCR。巢式PCR即为在原先设计的PCR引物内
侧再设计一对PCR引物,然后对第一次PCR产物进行稀释后再进行一次PCR扩增,这样一方面可以起到扩增作用,
同时也可以从第一次PCR产物中扩增出特异性条带。二次PCR则为比较简单地用原有引物对第一次PCR产物进行稀
释后再进行一次PCR扩增,可以起到扩增作用,但不能去除非特异性条带。
l. 模板中含有抑制PCR反应的物质,可以用适当的DNA纯化方法例如柱纯化等纯化模板DNA m. 当产生较多非特异性条带时,可以适当提高退火温度。 n. 注意设置适当的阳性对照和阴性对照通常会有很大帮助。
2-4min
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