GeneCopoeia All-in-One User Guide

使用说明书
GeneCopoeia Inc. 19520 Amaranth Drive Germantown, Maryland 20874 USA Tel: 301-515-6982; 1-866-360-9531 Fax:301-515-6983 Web: www.genecopoeia.com
All-in-One
TM
Q-PCR Primer Array 使用说明书
产品概述.
Real-Time PCR 技术是在 PCR 反应体系中添加荧光物质或含荧光基团的探针,利用荧光信号的积累实
时监控整个 PCR 的过程, 以达到对未知样品的定性或定量分析的目的, 与常规 PCR 技术和芯片技术比较,
All-in-One
品中具有相似生物功能的基因簇或自选的特异 Pathway 基因进行表达差异谱分析的系统。其已把优化并通
过实验验证的 96 对各异的 All-in-OneTM Q-PCR Primer 按使用浓度交联到 96-Well-qPCR 反应板中, 其中已
包含有四对内参基因引物,研究人员仅需加入 All-in-One
并且所得结果可通过在线数据分析系统(采用 ΔΔCt 分析方法)立即进行分析,利用这种 Ready-to-Use
Primer Array 及其已优化的实验条件,研究人员可以快速、精确的筛选出感兴趣的基因进行下游研究。
TM
Q-PCR Primer Array 是采用 SYBR Green 染料法检测的 Real-Time PCR 技术,对不同样
TM
Q-PCR Mix、cDNA 及 ddH2O,即可上机反应,
产品优势
1. 采用 Real-Time-PCR 技术进行样品间基因表达差异分析,具有快速、精确、定量、高通量等优点。
2.已对具有相似生物功能的基因簇或特异 Pathway 基因进行归纳整理到同一 Panel 中检测,可很直观
的筛选出具有特殊意义的基因进行下游功能研究。
TM
3. Ready-to-Use 的包装形式,仅需加入 All-in-One
便快捷。
4. 采用 ΔΔCt 分析方法的在线数据分析系统,快捷方便的进行结果处理
Q-PCR Mix、cDNA 及 ddH2O 即可进行反应,方
使用注意事项
1. 本产品采用常温寄送、请将其保存于+2℃~+8℃。
2. 在使用本产品前请充分去除表面积累的水份,并短暂离心。
3. 使用本产品前注意产品所提示的与之匹配Real-Time PCR仪器。
4.为防止污染,实验时请严格遵守标准的PCR流程。
产品提供形式
1All-in-One
及相对应数量的 qPCR 热封膜。
TM
Q-PCR Primer Array 产品提供的最小规格为 2 张交联有引物的 96-Well-qPCR 反应板
1
TM
2All-in-One
供四种与各仪器匹配的 96-well-qPCR 反应板的包装形式,如下所示:
包装形式 仪器公司 仪器型号
Q-PCR Primer Array 根据各研究人员实验室所使用 Real-Time PCR 仪器的不同,可提
ABI
Bio-Rad
A
Stratagene
PRISM SDS(7000、7300、7500、7700、7900)
iCycler iQ、MyiQ、iQ5、
Mx3000PMx3005PMX4000
Eppendorf
B
C
D
ABI
Bio-Rad(MJ)
Roche
PRISM SDS(7500fast、7900fast)
OpticonMJ)Opticon2MJ)Chromo4MJ
LightCycler480LightTyper System
另需配套试剂、耗材及仪器
1. First Strand cDNA Synthesis KitGeneCopoeia (Catalot C0210A )
2. 2×All-in-OneTM Q-PCR Mix:GeneCopoeia (Catalog# D0101A)
3. DNase/RNase污染的枪头和离心管。
4.与All-in-One
TM
Q-PCR Primer Array相配套的Real-Time PCR仪器
Realplex
■ 详细操作流程
1.Q-PCR 反应 Mix 量的准备
TM
公司同时提供有与 All-in-One
Real-Time PCR实验,研究人员可根据 96-well-qPCR Panel 的数量来确定 Q-PCR 反应数,一般 1 个 Panel
需要准备 100 qPCR 反应的 2×All-in-OneTM Q-PCR Mix,依次类推。
2.RNA 样品操作前的准备工作
为避免 RNase 对 RNA 样品的污染,所有实验要严格遵守 RNA 操作的要求。在实验前需准备高温
高压灭菌的微量离心管和移液枪头(如有条件,尽可能使用 DEPC 处理的耗材);在实验操作中,
戴口罩和一次性橡胶手套;所有反应液的配制等都需在冰上完成。
3RNA 样品准备
高质量的 RNA 是基因表达精确检测的首要条件,对于抽提的 RNA 必须保证 RNA 无降解、无
DNARNase 及抑制剂污染。RNA 是否有降解可通过甲醛变性胶电泳检测,理论上当 28S:18S=2:1
时基本可以判定 RNA 无降解。同时 RNA 的质量还可以通过紫外分光光度法检测,质量好的 RNA
Q-PCR Primer Array 配套的 2×All-in-OneTM Q-PCR Mix 以供进行
2
OD
应在 1.7~2.0 范围内。
260/280
4cDNA 的准备
高质量的 cDNA 也是基因表达精确检测的必要条件。建议使用 First Strand cDNA Synthesis
Kit(Catalot# C0210A) 进行 RNA 的反转录,其具体反转录流程可参考如下:
a. 融解 First Strand cDNA Synthesis Kit 内的试剂,上下轻微颠倒混匀,短暂离心后放置冰上待用。
b. RNA-Primer Mix 的配制反应
往放置于冰上的 RNase free 的反应管内加入以下试剂
试剂组分 标准反应 2倍标准反应体系★
total RNA★ 1μg 2μg
250μM Random Primer
DEPC H
O 至总体积 13μl 至总体积 26μl
2
1μl
2μl
★ 请使用足量的 RNA 进行反转录,建议每个标准反应 RNA 的量控制在 500ng~2μg 之间,如
每标准反应 RNA 量小于 100ng 进行反转录可能会影响低表达基因的检测。
★ 因引物锚定的序列位置不一致,为提高反转录效率及扩增效率,建议使用随机引物反转录
因一个 Panel 检测一个样品的表达,考虑到 cDNA 的使用量问题,建议采用 2 倍标准反应
体系进行 RNA 反转录,如同一个样品要进行 2 个或更多 Panel 的检测,请按 2 倍标准反应
体系重复进行 2 次或更多次的反转录
c. RNA 变性
混匀 RNA-Primer Mix,短暂离心,直接 65℃变性 10min 后立即放置冰上。这有助于减弱 RNA
级结构对反转录的影响,从而提高反转录效率。
d. 配制反转录反应液。
RNA-Primer Mix 反应管内加入以下试剂
试剂组分 标准反应 2倍标准反应体系★
RNA-Primer Mix
5×RT Reaction Buffer
25mM dNTP
25U/μl RNase Inhibitor
200U/μl M-MLV RTase (RNase H free)
ddH
O(DNase/RNase Free)
2
13μl
5μl
1μl
1μl
1μl
4μl
26μl
10μl
2μl
2μl
2μl
8μl
Final Volume 25μl 50μl
e. 反转录反应
反应条件设置为 37℃反应 1 小时。反应结束后,85℃灭活处理 5min
f.cDNA 样品处理及保存
混合相同样品反转录成的 cDNA 产物,用 ddH2O 稀释 5 倍,-20℃保存待用。
3
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