Agilent 2100 User Manual

Bioanalyseur 2100 Agilent

Une plate-forme... Des possibilités infinies pour les analyses d’ADN, d’ARN, de protéines et de cellules

Technologie appliquée de laboratoire-sur-puceBioanalyseur Agilent 2100

Des analyses biochimiques dont l’automatisation et la rapidité n’ont d’égale que l’excellence de la qualité des données

Le bioanalyseur Agilent 2100 constitue la méthode standard pour le contrôle qualité des échantillons d’ARN et remplace dans ce domaine l’électrophorèse sur gel qui demandait beaucoup de travail. Il est aussi en passe de se substituer à l’électrophorèse sur gel pour l’analyse de fragments d’ADN et l’analyse des protéines par la méthode SDS-PAGE. L’une des caractéristiques spécifiques du bioanalyseur Agilent 2100 est sa capacité à effectuer à la fois des

DÉFINITION

INSTALLATION

MISE EN ROUTE

UTILISATION

Qualification

de la définition

Qualification

de l’installation

Qualification

opérationnelle

Qualification

des performances

séparations par électrophorèse et les analyses des paramètres de fluorescence des cellules en cytométrie de flux. Grâce à cette souplesse, le bioanalyseur Agilent 2100 est devenu l’outil indispensable du biologiste moléculaire et du biochimiste.

La miniaturisation de l’instrumentation analytique présente un grand nombre d’avantages par rapport aux techniques traditionnelles. Ces avantages tiennent principalement à l’amélioration de la

précision et de la reproductibilité des données, à la faible durée des analyses, à la consommation minimale d’échantillon et à l’amélioration de l’automatisation et de l’intégration des analyses dans les processus complexes. Lancé en 1999, le bioanalyseur Agilent 2100 fut le premier instrument commercialisé à utiliser la microfluidique pour l’analyse d’échantillons biologiques.

Avantages du bioanalyseur Agilent 2100 :

• Kits de dosage et réactifs prêts à l’emploi.

• Consommation minimale d’échantillon (1 à 4 µL) et résultats sous 30 minutes.

• Amélioration de l’exactitude et de la fidélité des dosages.

• Résultats comparables d’un laboratoire à un autre.

• Données numériques facilitant l’analyse, l’archivage et le stockage.

• Choix de l’option d’affichage des données : bandes de type gel, électrophérogrammes et tableaux.

• Facilité d’utilisation grâce à la comparaison simplifiée des échantillons.

• Exposition minimale à des substances dangereuses.

• Prise en charge des exigences du code 21 CFR Part 11.

Deux configurations sont proposées :

• Bioanalyseur Agilent 2100 à cartouches remplaçables, pour l’électrophorèse et la cytométrie de flux.

• Bioanalyseur par électrophorèse Agilent 2100 à cartouches remplaçables, pour électrophorèse uniquement.

Les deux configurations comprennent :

1. une base d’amorçage de la puce,

2. un agitateur de type vortex pour la

puce,

3. le logiciel expert Agilent 2100 pour le pilotage de l’instrument et l’analyse des données (avec options d’extension prenant en charge les éventuelles exigences réglementaires),

4. des services et une assistance pour le système et ses applications.

Bioanalyseur Agilent 2100 (existe aussi avec ordinateur de bureau ou portable et imprimante)

Exemples d’applications

Le bioanalyseur Agilent 2100 est cité dans plus de 4500 références de la littérature scientifique.

• CQ des échantillons d’ARN avant analyses sur puces ou PCR quantitative (qPCR).

• Analyse de l’ADN de produits de réactions PCR/mPCR (multiplex) et PCR en temps réel.

• Analyse de l’expression des protéines

• Analyse de pureté pendant la purification des protéines.

• Analyse cellulaire pour le silençage de gènes ou l’apoptose.

Une large gamme d’applications avec un seul système compact

Instrument polyvalent conçu pour rationaliser les tâches depuis la recherche et le développement de produits actifs nouveaux jusqu’à l’AQ/CQ de l’industrie pharmaceutique, le bioanalyseur Agilent 2100 est l’instrument de microfluidique le plus répandu à ce jour pour l’analyse des protéines, ADN, ARN et cellules.

1. Rapide et simple d’emploi

Chargez l’échantillon

2. Automatisation

Démarrez l’analyse

3. Résultats numériques en 30 minutes

Suivez l’affichage en temps réel

• Kits de réactifs prêts à l’emploi.

• Instructions de prise en main rapide.

• Préparation de la puce en moins de cinq minutes.

• Utilisation minimale de produits chimiques dangereux et élimination des déchets.

• Quelques µL d’échantillon suffisent.

• Démarrage par pression d’un bouton.

• Protocoles prédéfinis.

• Utilisation d’un étalonnage interne pour le calcul des résultats.

• Analyse automatique de 12 échantillons maximum.

• Analyse automatisée des données.

• Les données numériques peuvent être partagées avec d’autres applications ou programmes.

• L’interprétation des données est indépendante de l’utilisateur.

• Algorithme RIN pour le contrôle qualité de l’ARN.

1. L’échantillon se déplace dans

les microcanaux depuis le puits d’échantillon.

2. L’échantillon est injecté dans le

canal de séparation.

3. Les composants de l’échantillon

sont séparés par électrophorèse.

4. Les composants sont détectés par

leur fluorescence et les résultats sont présentés sous une forme comparable à celle d’un gel (bandes) et à un électrophérogramme (pics).

1.1. 1.2. 3. 4.

C’est la seule plate-forme commercialisée capable de couvrir en un seul instrument de nombreuses étapes de la chaîne analytique à mettre en œuvre. En tant que premier instrument analytique du type laboratoire-sur-puce, le bioanalyseur 2100 a démontré sa capacité à offrir une solution de remplacement rapide

et conviviale à la méthode difficile et accaparante de l’électrophorèse sur gel. Il améliore et réduit les temps d’analyse de techniques demandant beaucoup de temps (gels d’agarose et SDS-PAGE) grâce à des techniques numériques automatisées donnant rapidement des résultats de haute qualité.

Kits ARN Série II

Contrôle qualité d’ARN rapide avec une consommation minimale d’échantillon

Avez-vous besoin d’une méthode normalisée pour contrôler la qualité de votre ARN total après son isolement ? Êtes-vous confiant dans la qualité de votre ARNm ou de votre ARN marqué par Cy5 ? Agilent vous propose des kits de dosage d’ARN qui permettent de caractériser les échantillons d’ARN total ou d’ARNm et d’estimer en quelques minutes leur concentration. Ces tests ne nécessitent que quelques nano- ou picogrammes d’échantillon.

RIN = 9,2

RIN = 5,8

Fluorescence Fluorescence

Temps [s]

19 24 29 34 39 44 49 54 59 64 69

Avantages des kits ARN offrant une sensibilité de l’ordre du nano ou du picogramme

• Facteur d’intégrité RIN (RNA Integrity Number) - normalisation du CQ de l’ARN.

• 1 µL d’échantillon consommé 50 pg d’ARN total suffisent pour l’analyse. Économisez vos précieuses préparations.

• Sans RNase - les réactifs et puces sont sans RNase pour éviter la dégradation de l’échantillon pendant l’analyse.

• Propre - exposition minimale aux substances dangereuses telles que le bromure d’éthidium.

Qualité de l’ARN

• Identifiez la dégradation de l’ARN total grâce au facteur d’intégrité (RIN).

• Identifiez la dégradation de l’ARNm.

• Une sensibilité inégalée à l’échelle du picogramme, pour une consommation minimale d’échantillon.

ARN total intact

ARN partiellement

dégradé

La dégradation des échantillons d’ARN par la RNase explique fréquemment les échecs expérimentaux en aval. Grâce au bioanalyseur Agilent 2100, visualisez les résultats du contrôle de l’ARN sous forme de bandes de type gel et de pics d’électrophorèse et détectez facilement les effets dus à une dégradation, même les plus ténus. Un facteur d’intégrité ou RIN (RNA Integrity Number) est en outre attribué à chaque échantillon d’ARN total, ce qui permet la normalisation des analyses.

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